На Кипре обнаружили вариант коронавируса, соединивший мутации дельта- и омикрон-штаммов. Об этом сообщили крупнейшие мировые СМИ. Эксперты давно ждали какую-нибудь необычную рекомбинацию разных линий SARS-CoV-2, однако в реальности «дельтакрона» возникли сомнения.
В субботу, 8 января, профессор Леонтиос Кострикис, глава лаборатории биотехнологий и молекулярной вирусологии Университета Кипра, заявил, что в 25 образцах биоматериала, полученных у 11 госпитализированных и 14 амбулаторных пациентов с положительным тестом на COVID-19, выявили коронавирус с мутациями как дельта-, так и омикрон-штамма.
У гибрида геном «дельты» и порядка десяти изменений, присущих «омикрону», уточнил профессор. По его мнению, скорее всего, этот «дельтакрон» не выдержит конкуренции с «омикроном». На Кипре геномы коронавируса секвенируют очень мало. В публичной базе данных GISAID за все время оттуда — лишь 765 образцов. В последние месяцы — ни одного, отмечает в Facebook генетик из США Дмитрий Прусс. Хотя заболеваемость там растет с ноября.
И вдруг 7 января в GISAID появились 24 (а не 25, как писали СМИ) кипрские последовательности из образцов, взятых 24 декабря. До этого в лаборатории Кострикиса не идентифицировали ни одного «омикрона», утверждает Прусс. Не исключено, что это ошибка секвенирования, загрязнение. «Пока более опытная лаборатория не подтвердит результаты, я остаюсь скептиком», — заключает ученый.
С ним согласны и другие специалисты. В частности, Том Пикок, генетик из Imperial College в Великобритании, один из открывателей «омикрона», указывает в твиттере, что кипрский «дельтакрон» — совершенно очевидно контаминация, поскольку последовательности не образуют кластер на эволюционном дереве.
Из 24 геномов с Кипра у 19 есть общая мутация — делеция 69-70 в спайк-белке, как у альфа-варианта. У остальных видны разные изменения, свойственные «омикрону», пишет генетик из Израиля Шай Фляйшон, тоже в твиттере. Он также обращает внимание на то, что все образцы «дельтакрона» — не связанные между собой разновидности «дельты». «Если это те самые 24 кипрских генома, то тут определенно контаминация», — делает вывод израильтянин.
Сомневается в реальности «дельтакрона» и российский генетик Константин Северинов. В стриме на ютьюб-канале у Александра Плющева он поясняет, что такой результат может возникнуть при определенных технологиях секвенирования, при коинфекции или загрязнении. «Это просто перемешанные вирусы, выделенные у одного человека», — говорит ученый.
Профессор Кострикис с коллегами настаивают на «дельтакроне», отмечает Bloomberg. Это следствие эволюционного отбора, утверждают они. Кроме того, геномы гибрида выявили в других странах, в частности в Израиле.
О возможности рекомбинантного варианта генетики предупреждали давно. Вирусы способны перемешивать геномы и образовывать новые штаммы. Об этом говорил, к примеру, Том Пикок.
Пока же в США и Европе «омикрон» стремительно вытесняет «дельту». Он более заразный, пробивает иммунную защиту, но, по предварительным оценкам, болезнь протекает легче. Ранее биоинформатик Владимир Щур из ВШЭ предположил, что в России «омикрон» станет заметным к концу января.